論文を読んでいて、どうしてもわからなかったのでお聞きしたいです。
同じサンプルを同じ制限酵素(Xba(1))で処理しているのに、サザン解析の結果では様々な位置にバンドが検出されているというのは、何を表しているのでしょうか?
その後、別の制限酵素(Hind(3)とSst(1))でも処理を行ない、そのときは、同じ位置にバンドが検出されたと載っていました。
サンプルはGUSレポーター遺伝子を融合したDNAを使用しており、そのGUSレポーター遺伝子にハイブリダイゼーションするプローブを使用したそうです。
サザンブロットの知識があまりないため、わかりにくい質問かもしれませんが、よろしくお願いします。
A 回答 (3件)
- 最新から表示
- 回答順に表示
No.3
- 回答日時:
御聞きした手前、思わず論文を読んでしまいましたよ。
。。。pBISPG上にXbaI, HindIII, SstIが一カ所ずつありますね。#2さんのお答えに補足の形で言えば、
Genetic transformation of the six strawberry
lines was further verified by genomic Southern blot analysis.とありますから、遺伝子導入(形質転換)したラインが6ラインあり、その遺伝子導入がちゃんとうまく言っているかをサザンでさらに確認したということです。
Hind(3)とSst(1)での処理で一本のバンドが出ているから、このレポーター遺伝子のプロモーターからコーディングまでに異常な組み替え等が起こって発現しないようなクローンになってはいない。とも言っていますね。
論文まで読んでいただいて、ほんとにありがとうございます。
私がきちんと論文を読んでいたら、わかる事だったみたいで反省です。
でも、自分1人で考えていたら行き詰まってしまってどうしようもなかったんで、ほんと考え方の方向転換をさしてもらえてよかったです。
ありがとうございました。
No.2
- 回答日時:
論文は、目を通していないので、推測です。
まず、同じサンプルといっていますが、おそらく、同じサンプルではないですね。
同じベクターで形質転換しても、染色体上の組込み部位は、様々です。
XbaIで処理した場合は、ベクター上にXbaIサイトが無いか、または1つだけなので、組み込み部位によって違う長さの断片になります。
一方、HindIII, SStIで処理した場合は、ベクター上の2箇所で切れるので、どこに組み込まれても同じサイズの断片が出てきます。
ということでしょう。
考え方の参考になりました。
同じサンプルでないという事を頭にいれて、もう1度論文読み直してみます。(自分で訳した訳が、間違っているのかもしれませんし。)
ご意見ありがとうございました。
No.1
- 回答日時:
上記のご質問だけでお答えできるかたもいらっしゃるかもしれませんが、
ここで言っている、同じサンプルとはなんですか?
ショウジョウバエのゲノムDNA?
in vitroのリモデリングアッセイ?
サザンブロットは検出方法なので、論文のその実験について補足していただけませんか?
この回答への補足
すいません。説明不足でしたね。
GUSレポーター遺伝子を下流に組み込んだAtSUC2という遺伝子の、プロモーターを調べる実験です。
具体的には、イチゴにこのプロモーターを組み込んだプラスミドを持つアグロバクテリウムを感染させ、形質転換体をGUS染色などを行い、調査していました。
サンプルは、このイチゴの植物体からDNAを抽出したものです。
以下のURLの論文です。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cm …
お探しのQ&Aが見つからない時は、教えて!gooで質問しましょう!
似たような質問が見つかりました
- 生物学 大腸菌とプラスミド 1 2022/07/04 01:40
- 生物学 シャトルベクターの大腸菌への形質転換 1 2022/07/02 23:19
- アイドル・グラビアアイドル 政治家や60〜70代以降の男性が女性のことを卑下している人が多いのはどうしてですか? 3 2022/03/26 16:14
- 就職 女子アナの採用選考は憲法違反ではないでしょうか? 3 2022/08/20 12:12
- 医学 女性の飲酒の是非について 2 2022/03/26 16:40
- 企画・マーケティング 女性をターゲットにしたお酒の開発・販売が遅れたのはどうしてだと思いますか? 1 2022/03/26 14:38
- 大学・短大 女子大生(成人している大学2年以降の学生)の飲酒とリスクについて質問です。 5 2022/03/26 19:45
- 運転免許・教習所 酒気帯び運転違反(飲酒運転)について質問です。 5 2022/04/01 19:51
- 運転免許・教習所 酒気帯び運転違反(飲酒運転)について質問です。 6 2022/07/17 11:16
- 倫理・人権 法の下の平等という概念の必要性の有無についてどう思いますか? 4 2022/04/02 14:41
おすすめ情報
デイリーランキングこのカテゴリの人気デイリーQ&Aランキング
-
m/mという書き方って正しいの?
-
レポートの最後に「以上」とい...
-
引用元が辞書の場合の論文の書き方
-
「~という」「~といった」は...
-
論文・レポートで引用文の中に...
-
参考史料と参考文献の違い
-
「〜ではないでしょうか。」 と...
-
学会発表に関して ほぼ同一の...
-
紀要と論文のちがいについて
-
雑誌論文を読んでいる最中の状...
-
投稿した論文の誤りで困っています
-
「〜してくれた」は小論文で使...
-
論文て「、」を「,」にしてる...
-
レポートの参考文献の書き方に...
-
文章の数字順規則
-
レポートの参考文献にマンガの○...
-
論文における in vitro、in viv...
-
「頸動脈」と「頚動脈」、どち...
-
文中で英語が斜めに表記されて...
-
「文字数に限りがある」という...
マンスリーランキングこのカテゴリの人気マンスリーQ&Aランキング
-
m/mという書き方って正しいの?
-
論文・レポートで引用文の中に...
-
「〜ではないでしょうか。」 と...
-
レポートの最後に「以上」とい...
-
学会発表に関して ほぼ同一の...
-
「~という」「~といった」は...
-
投稿した論文の誤りで困っています
-
論文の「今後の課題」の書き方
-
「〜してくれた」は小論文で使...
-
論文て「、」を「,」にしてる...
-
自分が書いた論文の謙譲語は
-
文中で英語が斜めに表記されて...
-
引用元が辞書の場合の論文の書き方
-
「文字数に限りがある」という...
-
「以下、~という」を英語で
-
外国文献
-
雑誌論文を読んでいる最中の状...
-
論文における in vitro、in viv...
-
レポートの参考文献にマンガの○...
-
文章の数字順規則
おすすめ情報