サーバーの容量が100%になってしまいました - ハードウェア(サーバー) - 教えて！goo

現在仕事でCGIの作成をしているのですが、一昨日の18:00頃まで作業出来ていたのに、昨日の朝にFFFTPでファイルをUPしようとした所、
次のエラーが出てUPできなくなってしまいました。
452 Transfer aborted. No space left on device

レンタルサーバのサポートに問い合わせた所、ファイルをアップするディレクトリの使用率が100%になっている為だと言われました。
SSHでdfコマンドで確認した所、下記のような状態になっています。
Filesystem　1K-ブロック　使用　　　使用可　使用%　マウント位置
/dev/hda1　　10080488　2052104　　7516316　22%　　/
/dev/hda4　　58617212　55640588　　0　　　100%　　/home
none　　　　　252324　　0　　　　　252324　0%　　　/dev/shm
/dev/hda2　　8064304　　246280　　7408368　4%　　　/var
(ここまで使用率が増えた原因は不明だと言われました。)

そこで/home下のディレクトリを次の方法で調べてみました。(ここからはサポート対象外でした)
[root@www home]#du -a　を実行し、各ファイルの容量をチェックしていきました。
ですが、上記で示した使用　55640588　100% /home　程、容量を使用しているものを見つけられませんでした。

諸事情で今迄の管理者が不在の為、サーバ、コマンド等についてほとんど知識のない自分が対応している状態です。
現在行っているCGIの作成もサーバを復帰させなければ進められない状態で困っています。

上記の/home以下の容量を空ければ良いと思うのですが、調べ方に間違いがあるのでしょうか？また、容量の大きいファイルを見つけても
消して良いファイルかどうかの区別もつきません・・・

OSはRedHat9です。わからない事だらけでお手上げ状態です・・・詳しい方がいらっしゃいましたらご指導いただけないでしょうか。
よろしくお願いいたします。