昼運行している高速バス… - 国内旅行(全国) - 教えて！goo

JRでなくても良いという事ですので、以下のサイトのURLを掲載しておきます。
自分がよく利用しているサイトです。

発車オーライネット
http://www.j-bus.co.jp/new_module/index.html
格安チケット ホットドッグ
http://www.hotdog.co.jp/index.htm

各々モバイルサイトがありますので、携帯電話から予約・購入が出来ます。

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たぶんですが、直接予約センターに電話してみましたか？
路線やバス会社によっても違いがあるんで絶対とは言いませんが、
場合によっては電話でも予約うけて当日出発（乗車）までに窓口で切符かえばよいこともおおいです。

少なくとも、JRバスならみどりの窓口とかでも買えたともいますので、窓口にさえいければ空きがあるかぎり買えると思いますが。

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