ホノルルからカパルアまで（ハワイアン航空） - 海外旅行(全般) - 教えて！goo

ANAからカパルアまでアロハエアー経由で手配していたんですが
アロハ航空が運航停止になりハワイアンエアー経由で取り直しとなりました。

カパルアまでの機材はアイランドエアーですが
アイランドエアー、ハワイアンエアーのHPでスケジュールを
確認すると
HNL発　　　JHM着
11：10am→11：42am
11：45am→12:17pm
02：05pm→02:37pm
　
と11時台共に2便が載っています。
ところが、ANA側に確認すると11：45の便が手配出来ないと
言われました。11：45の便はANA側の端末に出ないそうです。

ハワイアンのほうが登録していないからではないかと言われました。
今回、子どものチケットだけ有償手配で大人のチケットは
特典航空券利用なのでホノルル→カパルアまでは個人で既に手配を
してしまっています。
（ANAのホノルル到着が9：35amなので一番乗り継ぎの良い11：45am発を既に手配してしまいました。）

現状、子どもの分だけチケットが取れていないことになっています。

このように同じハワイアンからでも便によって
ANAから手配出来ないことがよくあるのでしょうか？
ANA側からハワイアンに問い合わせることもしないと言われました。
登録されるかされないかは分からないが、今後こちらから折を見て
電話で確認して下さいとのことでした。

こんな場合待っていても登録されるようなことはあるのでしょうか？
ご存知の方がいらしたらアドバイス宜しくお願い致します。