業務委託契約で報酬から消費税が引かれてるんですが・・・ - その他(マネー) - 教えて！goo

あなたは、消費税を払わない人だから
払わない消費税分を引いているのだと思いますが、
そうすると、あなたの収入は総額-消費税です。
先方が勘違いしているのでしょう。
消費税を払わない人は、消費税分はもらっても良いことに
なっていますので、もらっていないなら収入にはなりませんが
消費税分という経費はありませんので、総収入自体を
訂正してもらう必要があります。

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＞(1),業務委託契約として働いている…

消費税の課税要件は満たしています。
http://www.nta.go.jp/taxanswer/shohi/6105.htm

＞(3),総支給－源泉徴収税…

個人だからといって、何でもかんでも源泉徴収されるわけではありません。
源泉徴収されるのは、指定されたいくつかの職種の場合だけです。
何のインストラクターなのか、下記にあなたの職種が載っているかどうかお確かめください。
http://www.nta.go.jp/taxanswer/gensen/2792.htm
http://www.nta.go.jp/shiraberu/ippanjoho/pamph/g …

＞－消費税＝手取り　となります…
＞質問１：(1)のとおり、総支給から自動的に消費税が引かれているわけですが…

消費税は取られるのでなく、もらうものです。

＞年収が1000万以下の人も消費税を払わなければならないのでしょうか…

「年収」は関係ありません。
前々年の「課税売上高」が 1,000万円以下の事業者は免税事業者であって、国への納付義務はありませんが、顧客からもらうことは認められています。
もらった消費税は売上に含めて所得税の課税対象とします。
http://www.nta.go.jp/taxanswer/shohi/6501.htm

また、2年前が 1,000万円を超えている場合はもちろん、1,000万円以下でもあえて課税事業者になることもできます。
その場合でも消費税は自分で申告納付するものであって、源泉徴収などされるものではありません。
http://www.nta.go.jp/taxanswer/shohi/6601.htm

＞質問２：１で、消費税を払わなくて良い場合は、今までの分を会社から支払って…

消費税名目で天引きされることはおかしいです。

＞質問３：１で、消費税を払わなければならない場合、確定申告で控除の対象になるでしょうか…

「控除」などということはありません。
所得税と消費税は別物です。

＞質問４：消費税を払わなければならない場合でも、自動引き落としと自分で払うのでは…

繰り返しになりますが、自動引き落としなどということは、制度上あり得ません。
申告納付です。

税金について詳しくは、国税庁の『タックスアンサー』をどうぞ。
http://www.nta.go.jp/taxanswer/index2.htm

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