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微生物の名前とか菌名の正しい発音が知りたいという質問でしょうか?
日本語で良いページはありませんね…。微生物学の本を読まれることをお勧めします。それに、カタカナ読みだと、結構無理やりなことも多いのであまりおすすめはできません。
研究者の間で使われているメジャーな読み方を覚えられるほうが良いと思います。ですから、個々の菌名の読み方が分からない場合は、知っていそうな研究者に直接聞くか、Youtube等の動画サイトで研究者の正しい発音を聞くことをお勧めします。
微生物の一般的な分類の話は例えば以下に載っています。
https://www.mitsui-norin.co.jp/mmid/knowledge/yo …
たくさんカタカナで名前が載っている、というページなら例えば以下がありました。
http://www.ekouhou.net/%E5%BE%AE%E7%94%9F%E7%89% …
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