スクリプトの書き方について教えてください。

最近研究室でバイオインフォマティクスを始めた者です。
ゲノムをアノテーションするツールで解析を行うためのバッチスクリプトを書く際に、複数あるプロセスから、各プロセスで異なるtempファイルを作成したいです。（プロセス１ではtemp1, プロセス２ではtemp2, etc. といったような感じです）
色々考えてみたのですが、コードの書き方がよくわかりません。教えてください。
以下がバッチスクリプトです。

#!/bin/bash
#$ -S /bin/bash
#$ -cwd
#$ -pe def_slot 8
#$ -N ko_marine_bacteria
#$ -o stdout
#$ -e stderr

# perform kofam operation from file 1 to file 930
#$ -t 1-930:1
#$ -tc 10


#setting
source ~/.bash_profile
files=(`cat kofam_files`) #input files
TASK_ID=`expr ${SGE_TASK_ID} - 1`
#echo $TASK_ID
#echo ${files[$TASK_ID]}
~/kofamscan/bin/exec_annotation -o marine_kofam.txt --tmp-dir **** ${files[$TASK_ID]}


上記の****の部分にコードを記載することで実装できると思います。よろしくお願いします。
冒頭で言及している各プロセスというのはスクリプト内のfile 1 ~ file 930のことを指しています。

No.1 ベストアンサー 回答者： Gen_bamboo 回答日時： 2019/07/06 01:51

シェルスクリプトですね。

実行環境となっているOSは何でしょうか？

想像ですが、このようなものが参考になるのではないでしょうか。
https://ex1.m-yabe.com/archives/3485
https://sites.google.com/site/jyk5room/home/kai- …

この回答へのお礼

ありがとうございました。

お礼日時：2019/07/13 17:05