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昔はサザンブロットがよく行われていましたが、RIを使わなくてはいけない等の面倒なことがあったため(今はnon-RIでもできますが)、今の主流はPCR法だと思います。
マウスの尻尾を少し切ってプロテイナーゼ処理しその後ゲノムDNAを抽出しPCRを行います。そして普通のマウスとのバンドの長さの違いや有無によってノックアウト・トランスジェニックかを判定します。大抵そういったマウス作製時にタイピングしやすいようにターゲットベクターを構築するのが一般的だと思います。また最近はマウスの末梢血から直接ゲノムDNAを簡単に抽出できるキットも発売されているようです。お探しのQ&Aが見つからない時は、教えて!gooで質問しましょう!
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