No.2ベストアンサー
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アルカリ処理では染色体DNAも一本鎖に変性します。
これが、次の塩析処理で、SDS、たんぱく質とともに不溶性の複合体を作って沈殿します。スーパーコイル状態のプラスミドは変性しないので可溶性のまま残ります。これで、染色体DNAが除去できるわけです。ところが、アルカリ処理時間が長かったり、温度が高かったりすると、スーパーコイルもほどけて変性してしまいます。これを避けるために、氷温、短時間の処理をするのです。
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