CLAUSTALWをつかってbacteriorhodopsimのBAC1_HALS1,BAC2_HALS2,,,,,,,,,BACH_HALARを調べたのですが、
scoreとかいろいろ難しい言葉で書かれてあって、結果を読み取ることができませんでした。ですから、CLASTAL
Wの結果の読み取り方を教えて下さい。

A 回答 (2件)

補足拝見しました。

あなたが努力された事はわかりました(少し努力が足りないような気はしますが)。

>もちろん検索エンジンでも「CLASTALW」を調べましたが、ほとんどヒットしませんでした。インフォシークでも調べてみましたがヒットしませんでした。「CLASTALW」で検索したのですがスペル、大文字小文字など何か間違っていますか。
これがあっているとするとタイプミスです。ご使用のソフトは「CLASTALW」ではなく「CLUSTALW」です。と言いつつ,私の前回の回答も「CLAUSTALW」になってる。

で,私はインフォシ-クで引きましたが74件ヒットしました。その中の次のものは参考になるかも知れません。

・CLUSTALW HELP
 http://crick.genes.nig.ac.jp/homology/clustalw_h …

・Clustal W 1.Clustal W Clustal Wとはである. 多数のアミノ酸配列やゲノム配列の比較を ...
 http://www.sfc.keio.ac.jp/~t99540ho/ClustalW.html


なお,score とは比較している配列がどれだけ似ているかを示す数値です。インフォシ-ク等で検索した時に「・・・・・・:○○%」と出てくる○○%と同じです。

ところで,その先生は教えてくれないんですか。それとも何かの実習なのかな。しかし,本当にソフトを使いこなして,結果を正確に解釈するにはやっぱりマニュアルを読む必要があるでしょうね。マニュアルの英語はそんなに難しくないですから,頑張ってみて下さい。
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この回答へのお礼

ありがとうございました。CLUSTALWをCLASTALWと書いていたら努力不足といわれても仕方ないですね。

お礼日時:2001/02/07 15:02

あなたはどんなCLAUSTALWを使っていますか。

普通ソフトウェアにはマニュアルかヘルプが付いていて,そこに説明は書いてあると思います。最低限マニュアルは調べましょう。

なお,検索エンジン(インフォシ-ク等)で「CLAUSTALW」で引くだけで,「CLAUSTALW」自身のペ-ジを含めて多くのペ-ジがヒットします。

この回答への補足

マニュアルはついているんですけど全文英語でわからなかったです。
もちろん検索エンジンでも「CLASTALW」を調べましたが、ほとんどヒットしませんでした。
インフォシークでも調べてみましたがヒットしませんでした。
「CLASTALW」で検索したのですがスペル、大文字小文字など何か間違っていますか。
ぼくがつかったHPは、www.genome.ad.jp 先生が言うには東大のHPらしいです。

補足日時:2001/02/06 10:52
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 ・・最大重量         : 10Kg
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 ・・最大寸法(高さ+幅+長さ): 157cm 
    (超過寸法は、許可されない。)
 ・・個数 : 路線、幼児(2歳以下)、学生等によって異なるが、一般には次の通り。
....[国際線]            ビジネス:2個  エコノミー:2個
....[カリブ海諸国内と南アメリカ線] ビジネス:2個  エコノミー:1個
....[国内(Air Bridge)線]     ----- 個  エコノミー:1個
....[他の航空会社便と接続]    ビジネス:2個  エコノミー:2個

以上が概要ですが、ホームページには、
・上記の重量や個数を超えた荷物は有料となり、路線により料金が異なる。
・スポーツ器具や楽器等には、別途ガイドが有り。
・その他
等の情報も載っています。

回答がないようなので。。。

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>タンパク質っていうのは水の中で自動的に折れたたまりますよね。その理由が分からないので教えて下さい。
以前に類似の質問(NO.#31046, NO.#33643)に解答しましたので,そちらを御覧下さい。
http://www.okweb.ne.jp/kotaeru.php3?q=33643
http://www.okweb.ne.jp/kotaeru.php3?q=31046

>水以外の溶媒中(例えばアルコール)では折れたたまるのですか?その理由も教えて下さい。
タンパク質の折りたたみは水などの溶媒によって起こるものではなく,タンパク質自身の性質として起こるものと言えます。したがって,他の溶媒中でも折りたたみ自身は起こると言えます。しかし,ここで起こる折りたたみが水中で起こるものと同じかどうかは条件次第で何とも言えません。むしろ,アミノ酸残基と溶媒の相互作用が変わるために,異なった折りたたみ方が起こると考えた方が良いと思います。

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