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エクセルのグラフ作成ソフトを使って、正確な片対数のグラフを作ることは可能でしょうか?
現在遺伝子の研究をしているのですが、サンプルのDNAの分子量を求めるのに片対数グラフを書くことが必要なのです。手書きで書いてみたのですが、正確に書くことができません。 どうにか正確なものを書きたいと思ってるので、どなたか御存知の方の回答お願いします。

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A 回答 (2件)

片対数グラフを作成する方法は2つ。


1.折れ線グラフを作成し、y軸を選択後右クリックから、対数目盛りをチェックすると、y軸が対数目盛りになります。ただし、最小目盛りは10
2.散布図の線のついたものを選択し、作成。この場合はxまたはy軸を選択し、同じく対数目盛りを選択。

片対数グラフの場合は、折れ線、散布図どちらでも可能ですが、両対数の場合は散布図を選択することになります。
グラフは正確ですが、途中でデータを読む場合はメモリ間隔が荒いので、読みにくいと思います。
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この回答へのお礼

詳しい回答ありがとうございました。
教えてもらったとおりに早速エクセルでグラフを作成してみようと思います。

お礼日時:2003/11/05 16:11

あのぉ、質問の意図を理解していない可能性がありますが、、、一応答えます。



グラフの「軸の書式設定」XorY軸 を開く
「目盛り」タブを選択
下から3番目の「対数目盛を表示する」をチェック

で、対数グラフになります。
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この回答へのお礼

回答ありがとうございました。
早速エクセルを使用してグラフの作成をしたいと思います。

お礼日時:2003/11/05 16:09

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Qエクセルで片対数グラフを作る

エクセルで片対数グラフを作る方法を詳しく教えてください。お願いします。

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グラフの数値軸のところで右クリックして
軸の書式設定(O)→目盛(タブ名)

対数目盛を表示する(L)
にチェックを入れてください。

Q分子量とマーカー移動度の片対数グラフでの調べ方

SDS-PAGEにおける分子量とマーカー移動度の片対数グラフでの調べ方についての質問です。

コラーゲンI型についてウエスタンブロットを行ったところ、予想以上にバンドが出てしまいました。そこで、分子量とマーカーの移動度から検量線を作ることになりました。

マーカーの移動度を定規で測り、エクセルにて縦軸を分子量(対数)、横軸を移動距離としてグラフを作りました。
その後、近似直線(曲線?、指数近似)とその数式を出してみると、
右肩下がりのy = 497.41e^(-0.0297x)という数式が出ました。

分子量が大きい物ほど移動度が小さいというのはわかるのですが、これであっているのかわかりません。

また、その数式から分子量(y)が分かっているときに移動距離(x)を求めたいのですが、
=log(497.41*2.71828,y)/(-0.0297)で計算すると移動度がマイナスになってしまいます。

どこで間違っているのかが分かりません。
どなたかご教授頂ければ幸いです。

Aベストアンサー

書かれている計算式がよくわからないのですが、なんかlogの展開がおかしいような・・?

よくわからないのでlogの展開の決まりを下に書いておきますのでご自分で検算してください。
Y=A*B/Cを両辺対数取ります。対数取ると、かけ算は足し算に、割り算は引き算にします。
logY=logA+logB-logCです。
それから、e^(-x)=1/e^(x)です。つまり497.41e^(-0.0297x)=497.41/e^(0.0297x)

Qエクセルを使った片対数グラフ

エクセルを使い、方対数グラフを作りたいのですが、
Y軸0~700までの値、
X軸10~100000までの値をプロットしたかったのですけど、X軸のメモリが10、100、1000、10000…と指定できません。
メモリを右クリックして書式設定で変え様にも、目盛り感覚という値をいてれしまうと等間隔の目盛りになってしまいます。
どうしたら目盛りの間隔が10倍になりますか?

Aベストアンサー

まず、グラフの種類は、散布図になっていますか?

なっていれば、軸の上で右クリックをして、「軸の書式設定」ダイアログを表示してください。
その後、「目盛り」タブで、「対数目盛を表示する」にチェックすればよいかと。

QSDS-PAGEについて

大学の実験でやったSDS-PAGEのレポートを書くんですが、タンパク質の分子量と泳動度を使いグラフを作る課題があるんですが、kDというのが分子量だとは思うのですが泳動度をどのように求めたら良いのかがわかりません。参考書に比移動度というのがあり、分子量の対数に逆比例する。と書かれているものがあったのですが、これと泳動度は同じものなのでしょうか?この実験には分子量マーカーと成分のわからないタンパクを使ったのですが、マーカーを使いグラフを書くんでしょうか?生物系はまったく判らないのでよろしくお願いします。

Aベストアンサー

↓の参考URLを読んでみてください。
たぶん、お分かりになると思います。
説明の中でMrというのは分子量のことです。
分子量がわかっている数種類のタンパク質を、先行色素(ブロモフェノールブルー(BPB)など)とともに泳動させます。そして先行色素の泳動度を1としたときの、各試料の相対的な泳動度を比泳動度(Rf)といいます。
横軸にRf、縦軸にlog[分子量]をプロットすると、右下がりの直線に近いものが得られます。
この直線の式を最小二乗法によって求めます。
x = Rf, y = log[Mr]として
直線の式は y = ax + b
の形になるはずです。
(右下がりの直線なので、a<0)

これに分子量が未知の試料のRfの値を代入すれば、分子量が求められます。

参考URL:http://www.jp.amershambiosciences.com/products/kouryaku_electro/applic_guide/008-2.asp

Q電気泳動によりDNAの分子量を求める方法。

先日、実験でDNAの電気泳動を行いました。
それで、電気泳動の結果からDNAの分子量を求めなくてはならないのですが、いまいちよく分かりません。

電気泳動をしたのは標準マーカーと制限酵素処理する前のDNA、した後のDNAです。
標準マーカーはバンドが23、9.5、6.5、2.3、2.0に現れました。
制限酵素処理前のDNAはバンドが9.5に現れました。(した後については事情により省略させてください。)また、単位はKbpです。
自分でも考えてみたのですが、DNAの長さが分かっただけで分子量がどのように得られるのかさっぱり分かりません。
この結果からどのように分子量を求めていけばよいのでしょうか?
どなたかご教授願えませんでしょうか。よろしくお願いいたします。

Aベストアンサー

制限酵素処理する前のDNAはlinear DNAですか?plasmidだと制限酵素処理前だと環状をしていますので、正確なDNAの長さがでません。オープンサーキュラーとクローズドサーキュラーというやつです。制限処理をした後のバンドの長さの合計でDNAの全長を算出し、それに660をかければOKです。
ちなみにx660というのはbase pairtあたり660ということで、塩基base (A T G C)の平均分子量がだいたい330ということからの概算です。

Qエクセルで計算すると2.43E-19などと表示される。Eとは何ですか?

よろしくお願いします。
エクセルの回帰分析をすると有意水準で2.43E-19などと表示されますが
Eとは何でしょうか?

また、回帰分析の数字の意味が良く分からないのですが、
皆さんは独学されましたか?それとも講座などをうけたのでしょうか?

回帰分析でR2(決定係数)しかみていないのですが
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本を読んだのですがいまいち難しくて分かりません。
教えてください。
よろしくお願いします。

Aベストアンサー

★回答
・最初に『回帰分析』をここで説明するのは少し大変なので『E』のみ説明します。
・回答者 No.1 ~ No.3 さんと同じく『指数表記』の『Exponent』ですよ。
・『指数』って分かりますか?
・10→1.0E+1(1.0×10の1乗)→×10倍
・100→1.0E+2(1.0×10の2乗)→×100倍
・1000→1.0E+3(1.0×10の3乗)→×1000倍
・0.1→1.0E-1(1.0×1/10の1乗)→×1/10倍→÷10
・0.01→1.0E-2(1.0×1/10の2乗)→×1/100倍→÷100
・0.001→1.0E-3(1.0×1/10の3乗)→×1/1000倍→÷1000
・になります。ようするに 10 を n 乗すると元の数字になるための指数表記のことですよ。
・よって、『2.43E-19』とは?
 2.43×1/(10の19乗)で、
 2.43×1/10000000000000000000となり、
 2.43×0.0000000000000000001だから、
 0.000000000000000000243という数値を意味します。

補足:
・E+数値は 10、100、1000 という大きい数を表します。
・E-数値は 0.1、0.01、0.001 という小さい数を表します。
・数学では『2.43×10』の次に、小さい数字で上に『19』と表示します。→http://ja.wikipedia.org/wiki/%E6%8C%87%E6%95%B0%E8%A1%A8%E8%A8%98
・最後に『回帰分析』とは何?下の『参考URL』をどうぞ。→『数学』カテゴリで質問してみては?

参考URL:http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%9B%9E%E5%B8%B0%E5%88%86%E6%9E%90

★回答
・最初に『回帰分析』をここで説明するのは少し大変なので『E』のみ説明します。
・回答者 No.1 ~ No.3 さんと同じく『指数表記』の『Exponent』ですよ。
・『指数』って分かりますか?
・10→1.0E+1(1.0×10の1乗)→×10倍
・100→1.0E+2(1.0×10の2乗)→×100倍
・1000→1.0E+3(1.0×10の3乗)→×1000倍
・0.1→1.0E-1(1.0×1/10の1乗)→×1/10倍→÷10
・0.01→1.0E-2(1.0×1/10の2乗)→×1/100倍→÷100
・0.001→1.0E-3(1.0×1/10の3乗)→×1/1000倍→÷1000
・になります。ようするに 10 を n 乗すると元の数字になるた...続きを読む

Q片対数グラフのメモリの採り方を教えてください。

今レポートを作成しているのですが、片対数グラフのメモリの取り方がわからず困っています。

http://www.sccs.chukyo-u.ac.jp/classes/shimizu/hardware/
にある片対数グラフの用紙を印刷し、対数の方の座標軸に
1~1Mのメモリを打ちたいのですが、どう打てばいいのか
教えていただけないでしょうか。
兄いわく、「無理じゃないかな」というのですが。

フィルタ回路の周波数グラフをまとめるために必要なのです。
(パソコンで出力したものがあるのですが、自分で手書きで書くのも必要です。)

Aベストアンサー

semiloggraph.pdf を見ました.
片対数グラフ用紙では,対数側の方で同じものが何段積み重なっているかを
よくサイクルと言っています.
問題のグラフですと,3サイクルの片対数グラフということです.
対数目盛は普通の目盛りと違って,1目盛りを2単位にというようなことはできません.
つまり,3サイクルの片対数ですと,10^3 倍までしか表現できないことになります.
1K~1M なら大丈夫ですが,1~1M となると6サイクル必要ですね.

> 無理やり自己解決しました。
> 大きな3つの区切り(4点)ではじめから1,100,10000,1000000をとり、
> 10,1000,100000をその中点でとりました。
考え方自体は間違っていませんが,
意味のある目盛りはちょうど 1,10,100,...,100000 のところだけで,
他の目盛りは全く無意味になってしまいます(というか,邪魔ですよね).

本当に 1~1M をこの対数グラフ1枚でプロットしろというなら,
お兄さんの言われるように無理ですよね.
先生の側に問題ありです.

で,解決法ですが,2つ考えました.

(I) 常用対数の値を電卓で計算して,それを普通のグラフ用紙にプロットする.
1~1M でしたら,常用対数の範囲は 0~6 ですから
それが普通のグラフ用紙の縦に収まるように適当にスケールすればよい.

(II) 与えられている片対数グラフ用紙を2枚印刷して縦張り合わせてつなげる手もあります.
こうすると6サイクルになりますから 1~1M まで表現できますね.

semiloggraph.pdf を見ました.
片対数グラフ用紙では,対数側の方で同じものが何段積み重なっているかを
よくサイクルと言っています.
問題のグラフですと,3サイクルの片対数グラフということです.
対数目盛は普通の目盛りと違って,1目盛りを2単位にというようなことはできません.
つまり,3サイクルの片対数ですと,10^3 倍までしか表現できないことになります.
1K~1M なら大丈夫ですが,1~1M となると6サイクル必要ですね.

> 無理やり自己解決しました。
> 大きな3つの区切り(4点)で...続きを読む

Qエクセルの対数グラフで細かい目盛を入れる方法

エクセルで散布図、軸の書式設定で対数のグラフを
書きました。
しかしX軸の目盛が
100,1000,10000だけで読みにくいのです。
100,200,500・・・のようにもう少し細かい目盛を入れる
方法がありましたら教えてください。

Aベストアンサー

ただ単にグラフに目盛を増やしたいという意図でしょうか?
そうでであれば、下記を実行することで目盛だけ表示されます。

1.グラフのX軸を選択して右クリック⇒『軸の書式設定』を選択
(X軸をダブルクリックでも同様のことが行えます。)
2.『パターン』タブの「補助目盛の種類」の項目にある『内向き』にチェックを入れる。
3.OKボタンを押す。


グラフ上に目盛線を入れる場合であれば、下記の要領です。

1.グラフ上で右クリック⇒『グラフのオプション』を選択
2.『グラフオプション』の『目盛線』タブを選択
3.目盛線、補助目盛線にチェックを入れる
4.OKボタンを押す

上記で、グラフ上のX軸に目盛線が引けます。
あとは、補助目盛線だけ選択して、右クリックから『目盛線の書式設定』を
選択し、『パターン』タブで破線等に変えると見やすいかもしれませんね。

Q形質転換効率?の求め方

プラスミドの導入による細菌の形質転換のレポート作成中です。
形質転換効率(cfu/μg)求める式、どなたか教えていただけませんでしょうか??
また、プラスミドによる薬剤耐性化が問題となっている細菌感染症の例には、どのようなものがありますか??レポの提出日、明日なので、誰か助けてください><よろしくおねがいしますmm

Aベストアンサー

形質転換効率の意味を理解していれば、単純な割り算、掛け算です。特に公式のようなものはありません。
パラメータは
A. コロニーの数(プレーティングするを振っていたなら、数十から数百コロニーまいたプレートを採用します。少なすぎるとサンプリングによる振れが大きくなりますし、数えるのが不正確になります。同じ量をまいたプレートが複数ある場合は平均します)。

B. Aを与えたプレーティング細胞の体積
C. プレーティング細胞全体の体積(回復培養のため加えたSOC培地の体積でよろしい)
D. 使用したプラスミドベクターの重量(ライゲーション産物の場合はベクターの重量のみで、インサートは勘定にいれない)

計算例)
A=150 cfu, B=100 uL, C=1000 uL, D=1 ngとしましょう。

まいた100 uL中に含まれるプラスミド量は
1 ng x 100 uL/1000 uL=0.1 ng

そのプラスミド量で150個のコロニーが出たので、1 ugあたりに換算すると

150 cfu x 1 ug/0.1 ng= 150 cfu x 1 ug/0.0001 ug=1.5x10^6 cfu/ug

となります。単位につくmicro (uであらわしています), nano (n), pico (p)が順に1/1000ずつ小さいことをあらわすのは説明不用ですね。

薬剤耐性化の設問は、日常生活とのかかわりを問うているもので、専門知識よりむしろ新聞の社会欄に出てるような話題を求めているのではないですか。たとえば、院内感染で騒がれているのはどのような感染症でしょう。

形質転換効率の意味を理解していれば、単純な割り算、掛け算です。特に公式のようなものはありません。
パラメータは
A. コロニーの数(プレーティングするを振っていたなら、数十から数百コロニーまいたプレートを採用します。少なすぎるとサンプリングによる振れが大きくなりますし、数えるのが不正確になります。同じ量をまいたプレートが複数ある場合は平均します)。

B. Aを与えたプレーティング細胞の体積
C. プレーティング細胞全体の体積(回復培養のため加えたSOC培地の体積でよろしい)
D. 使用...続きを読む

QSDS-PAGE 移動度について

こんにちは!!
大変初歩的な質問で申し訳ないのですが、ご回答お願いいたします。

大学でタンパク質の精製実験をし、チトクロムCの純度が上がっていくのを確認するためにSDS-PAGEをおこないました。
SDS-PAGEでは、マーカーのRf値と分子量の対数値をプロットしたグラフを作成し、そこから分子量未知の試料の分子量を求めるということは理解しています。

Rf値は、ブロモフェノールブルーの移動度を1とした各試料の相対移動度であるということですが、ブロモフェノールブルーの移動度はどこからわかるのでしょうか。
SDS-PAGEの結果のカラーコピーがあるのですが、これをものさしで測ってやればいいのでしょうか?(>_<)
ご回答お願いします。
あと、試料は、タンパク質精製のいろいろな段階からとったもので3種類あります。これらの試料から、チトクロムCの純度を求めるのですが、これはSDS-PAGEで染色されたすべての部分の総分子量(1)とチトクロムCの分子量(2)をもちいて、
(2)/(1)で求めればいいのでしょうか?

いろいろな文献を読んでもわかりませんでした。
大変初歩的で申し訳ないですが、ご返答よろしくお願いします。

こんにちは!!
大変初歩的な質問で申し訳ないのですが、ご回答お願いいたします。

大学でタンパク質の精製実験をし、チトクロムCの純度が上がっていくのを確認するためにSDS-PAGEをおこないました。
SDS-PAGEでは、マーカーのRf値と分子量の対数値をプロットしたグラフを作成し、そこから分子量未知の試料の分子量を求めるということは理解しています。

Rf値は、ブロモフェノールブルーの移動度を1とした各試料の相対移動度であるということですが、ブロモフェノールブルーの移動度はどこからわかるので...続きを読む

Aベストアンサー

実習みたいな中身だけど、それなら担当教官に訊けば良いと思うが・・・?

>ブロモフェノールブルーの移動度を1とした各試料の相対移動度であるということですが、ブロモフェ
ノールブルーの移動度はどこからわかるのでしょうか。
意味がよくわかりませんが、ブロモフェノールブルーがどれだか解らないのですか?

>SDS-PAGEの結果のカラーコピーがあるのですが、これをものさしで測ってやればいいのでしょうか?
はい、そうです。普通はゲル上端からの距離を測ります。
ところで、バンドには太さがありますね。バンドの上端、真ん中、下端間での距離のうちどこが良いと思
いますか? 全てに当てはまるわけでは無いのですが、下端をおすすめします。なぜかというと、タンパ
ク質量をどんどん増やしてみます。するとバンドはどんどん太くなり、それにつれて、真ん中と上端の位
置はどんどん上がっていきますが、下端の位置はほぼ同じです(かなり大量になるともちろん下がって
きます)。比較的タンパク質量に依らずたいてい同じ位置になるので(ときどきあれ?というのはあるの
ですが)、下端が一番おすすめです。

>タンパク質精製のいろいろな段階からとったもので3種類あります。これらの試料から、チトクロムCの
純度を求めるのですが、これはSDS-PAGEで染色されたすべての部分の総分子量(1)とチトクロムC
の分子量(2)をもちいて, (2)/(1)で求めればいいのでしょうか?
全然違います。どのくらい純度があるかというのですから、チトクロムCのタンパク質量(重さ、つまり単
位はmgとか)/全タンパク質量(チトクロムCの量+それ以外のタンパク質量)、これが純度です。
 しかし、ゲルの中のタンパク質の量を重さで求めるのは無理があるので、タンパク質量と染色の濃さ
は比例し、かつ全てのタンパク質で比例常数は同じと仮定します。つまり、どのタンパク質のバンドで
あっても、バンドの染色の濃さをそのタンパク質の量としてしまうと言う意味です。 従ってスキャンイングのパ
ターンが必要になります。そこから、足し算、割り算をしてください。

実習みたいな中身だけど、それなら担当教官に訊けば良いと思うが・・・?

>ブロモフェノールブルーの移動度を1とした各試料の相対移動度であるということですが、ブロモフェ
ノールブルーの移動度はどこからわかるのでしょうか。
意味がよくわかりませんが、ブロモフェノールブルーがどれだか解らないのですか?

>SDS-PAGEの結果のカラーコピーがあるのですが、これをものさしで測ってやればいいのでしょうか?
はい、そうです。普通はゲル上端からの距離を測ります。
ところで、バンドには太さがありま...続きを読む


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