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選別する方法は以下の通りです。
(1) ベクター(またはファージ)に組み込んだライブラリーをプレートに撒き、コロニー(またはプラーク)を形成させることで個々のクローンに分離します。
(2) ナイロンメンブランなどでプレートのレプリカ(複製)を作り、そのレプリカを対象にして、目的の配列を放射性同位元素などで標識したものをプローブとしてハイブリダイゼーションを行い、ハイブリが起こった陽性クローンを特定します。
(3) 陽性クローンをプレートから回収し、培養します。
(擬陽性クローンを減らすため、(3)で得られた候補で再度(1)~(3)の工程を通すことが多いです)。
最終的に、得られたクローンからベクター(またはファージ)を回収し、配列を確認すること決定します。
この他、cDNAライブラリから直接PCRを行なって目的配列を得たり、ハイブリの替わりにマグネットビーズとプローブで目的配列を濃縮する方法もあります。
なお、cDNAライブラリーはmRNAから合成したcDNAを適当なベクターに組み込んだもので、ゲノムDNAライブラリーは適当なサイズにしたゲノムDNAを対象にしたライブラリーになります。
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