分子動力学

の検索結果 (69件 1〜 20 件を表示)

分子動力学計算ってどうやって勉強したら良いですか?

分子動力学計算ってどうやって勉強したら良いですか? よく分子動力学計算、モンテカルロ計算、といった計算方法の名前を耳にします。 図書館で計算物理学系の書籍を全て借りて読んで...…

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分子動力学 NVE法について

…古典力学初心者です。 分子動力学についての質問なのですが、NVE(もしくはNEV) アンサンブルでverlet法を使って原子や分子の動きを追うとき、計算間隔を狭くすれば、近似的に内部エネルギー...…

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分子動力学シミュレーションについて

分子動力学シミュレーションでは、荷電粒子の間の相互作用としてローレンツ力が考慮されていないと思うのですが、考慮する必要はないのでしょうか?…

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分子動力学計算ソフトtinkerのコンパイルについて。

分子動力学計算ソフトtinkerのコンパイルについて。 現在、計算化学の研究で分子動力学計算ソフトの"tinker"を用いて研究をしようとしています。 tinkerのフォルダーを自分のパソコン...…

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分子動力学シミュレーションについて

…学校の実験で、fortranを用いて分子動力学シミュレー ションのプログラムを作成中なのですが、手元の本では おおまかな概要しか記載されていないためまったく 進んでいません。 どなたか...…

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分子動力学で結晶の再現

分子動力学のシミュレーションで結晶構造の再現はできるのですか. 例えば、液体状態から金属が凝固するときにちゃんとその金属本来の 結晶構造になるかどうかや、温度で結晶構造を変...…

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分子動力学の歴史について

分子動力学の歴史について調べていてAlderという方が始めてMDを行ったことはわかったのですが,その内容について詳しく書いてある本やサイトをご存知でしたら教えてください. 剛体球を用...…

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分子動力学シミュレーションについて

…研究をすすめていく過程で、どうも分子動力学シミュレーションを使った方がよさそうな流れになってきました。 この計算は、大型計算機でのみ可能なのでしょうか? 自宅のPCでできると非...…

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分子動力学における応力の定義について

…現在分子動力学について勉強しており、下記URLにあるパワーポイントを見つけました。 http://www.fml.t.u-tokyo.ac.jp/lecture/lecture_6/lecture_MD.pdf その中の12ページに応力の定義が紹介されており、 σ...…

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第一原理分子動力学を用いた熱力学解析の零点振動

…第一原理分子動力学を用いた熱力学解析の零点振動の論文を読んでいるのですが、どういう意味なのかわからないことがあるのでわかる方がいらっしゃったら教えてください。 論文のテー...…

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分子動力学について

…10億個の原子の相互作用を10TFLOPSの計算機で計算すると何時間かかるのでしょうか? ネットでいろいろ検索してみましたが、載せられてる方程式も理解できないので苦しんでおります。…

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分子動力学とモンテカルロ法の勉強におススメの書籍を

…教えてくださいm(__)m 計算化学にトライしているのですが、この二つを理解しないといけない状況でして・・・ 漠然としていますが、お願いします。 また、tinkerの使い方に詳しい方、 いら...…

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ミクロとマクロ的な見地による現象解析

…現象を解析するには、ミクロ的見地とマクロ的見地があると思います。 例えば、物質の変位、応力等をマクロ的に解析する学問に連続体力学があります。 逆にミクロ的に解析するには、分...…

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分子シミュレーションにおける制限について

…パソコンで分子シミュレーションをするとき(モンテカルロ法や分子動力学法) 粒子を任意に配置してシミュレーションを始めますか? そしてもし任意に配置するとしたら、実際の系との間に...…

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分子シミュレーションについて

…分子シミュレーションで、ブタンの構造最適化、エチレンの振動解析、長鎖アルカンの分子動力学シミュレーションをおこないました。 これらの結果に関して考察をしようと思うのですが...…

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MEMSシミュレーションに必要な知識

…過去FEMによる数値解析を、構造解析応用メインで勉強指してきました。 今後興味のある分野として、MEMSデバイス(センサー等)のシミュレーションを考えています。 そこで必要となる知識を...…

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C++でアルゴリズムの本を探しています。

…C++でアルゴリズムの本を探しています。 何かオススメの良い本はありますか? ガラーキン・スペクトル・差分法(陽・陰。。。) 空間離散化・時間進行系。 簡単にいいますと、ヘルムホル...…

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FORTRANによるシミュレーション

…今年の4月に卒業研究でシリコンの変形・破壊機構をFortranを用いた分子動力学法で研究するんです。 研磨モデル・研削モデルの動画の作成の方法で行き詰まりです。 1月8日にFORTRANの入門書(...…

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温度制御の方法

…今私は大学で分子動力学シミュレーションを行っています。 そこで温度を制御する方法として、過去の論文に「能勢-フーバー法を用いた」という記述があったのですが、その詳しい方法は...…

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RNAの座標について

分子動力学のソフトウェア上でRNAの構造を作成しょうと思っています。 しかし、現在用いているソフトウェアにはデフォルトとして存在しておらず、非常に混迷の状態です。 そこで、1つ1...…

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