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ご推察通り2つとも電子証明書です。
“cer”はcertificateの意味で、主に自己証明書(ルート証明書)に使用されます。
ファイルをダブルクリックすれば証明書の内容が表示されます。
ちなみにASN.1のderエンコードされたバイナリデータです。
“pfx”はマイクロソフトの電子証明書の規格ですが、PKCS#12形式とほぼ同じです。
cer形式の電子証明書とRC2方式で暗号化した秘密鍵がパッケージされたもので、個人の証明書やSSLサーバー証明書をIISにインポートするときに使います。
こっちはパスワードが無いと中身を見ることができません。
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