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No.1
- 回答日時:
それは、既知の情報がどれだけあるかによりますね。
極端な話、ゲノムプロジェクト、cDNAプロジェクトが完了していて、市販品のマイクロアレイでもあったら、1ヶ月もかからずに仕事がおわってしまいます(笑)
常識的なところで、
1)花弁からmRNAを精製して、cDNAライブラリーを作る。
2)個々のクローンを(スクリーニングすることなしに)片っ端からピックアップする。
3)クローンを培養してDNAを精製する。または、PCRでcDNAインサートを増幅する。
4)cDNA末端のシークエンスをする。
cDNA末端のシークエンスを特に、EST (Expression Sequence Tag)といいます。全長がわからなくても、ESTがわかれば、何の遺伝子かわかることが多いですし、わからなくても、同じ遺伝子由来のもの同士を分類することができます。未知の遺伝子で、同定が必要なら、さらに内側や、全長のシースエンスをします。
同じ遺伝子由来のものがとれる頻度が、遺伝子の発現量を反映します。たくさんやれば、発現している遺伝子のカタログの出来上がりです。
花弁という特殊で限られた組織ですから、発現している遺伝子はそんなに多くないでしょう。数百から数千クローン拾えば、発現量のすくないものも、網羅できるのではないでしょうか。
ショウジョウバエのゲノムプロジェクトのサイトですが、参考になるでしょうか↓
参考URL:http://www.fruitfly.org/DGC/index.html
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