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エクセルのバージョンが書かれていませんが、Excel2007なら色フィルタが利用できます。
「データ」「フィルタ」「色フィルタ」でフィルタしたい色を選択してください。
色つき行の補助列にフラグを立てたいなら、マクロ関数を使うのが簡単かもしれません。
B1セルを選択して「挿入」「名前」「 定義」で「名前」をたとえば「iro」とし「参照範囲」に「=GET.CELL(63,!$A1)+NOW( )*0 」と入力します。
フラグを立てたいセルに「=(iro<>0)*1」と入力すれば、色つきのセルは1、それ以外は0と表示されます。
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