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染色体はもともと、真核生物の細胞周期の分裂期に見られるX状の構造のことを言います。
真核生物の核のなかにある染色体のことをあえて染色質とはあまり言わないような気がします。形態や細胞周期に関わらず、真核生物の細胞にあるDNAとヒストン、およびその他のタンパク質からなる生体物質を指す場合もあり、そのことを染色体と呼んだり染色質と呼んだりします。
さらに、真正細菌や古細菌、ミトコンドリアや葉緑体のゲノム、ウイルスのゲノムも染色体や染色質と呼ぶ場合があります。
要するに、場合によって染色質か染色体か使い分けないと変に聞こえたり恥をかいたりするかもしれないという程度ではないでしょうか。
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