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「元素」として書くか、現実に存在する「物質」として書くかの違いなんでしょうね。
イオンになるのは、原子だったり(H+、Cl-)、物質だったり(OH-、SO4(2-))します。
金属は原子の結晶の形で「物質」として存在するので、「金属の~」としtがときに「元素」と考えるか「物質」と考えるかで、元素なら「H」、物質なら「H2」と書いているのでしょうね。
どちらが正しい、間違っているということではなく、「どのような観点・分類で書かれているか」という違いかと思います。
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