売上１千万円以下の業者が消費税を課税してもいいのですか？ - その他(マネー) - 教えて！goo

消費税のことで質問します。

消費税は年間で売上１千万円を超える業者に対して課税義務があると思いますが、中には個人事業でどう見ても売上がそこまでないような店が消費税を取っている場合があります。

これって問題ではないのでしょうか？
要するに商品の金額に５％上乗せして金を取っておいて、でもその５％分はそのままその店の収入計上しているだけだとすると、おかしいと思います。
でも、一般的にはこういうことをやっている業者っていくらでもあるような気がします。ネットで販売している業者とか。

どうなのでしょうか？