iPod Shuffle：iTunesのライブラリから曲を削除すると、Shuffleからも同じ曲が消えてしまう… - iPod・携帯音楽プレーヤー - 教えて！goo

それがiPodシリーズの常識です。
設定を変更していない限りそうなるのがiPodを使う上での大前提です。
普通のiPodではそうならなかった、と言うのは
そうならない様に設定を変更していた、と言う事になります。

iPodの発売当時のキャッチコピーは「iTunesを持ち歩こう」です。
iPodとiTunesは別々のものではなくセットだと言う事です。
iTunesから消す、イコールその曲はいらない、となります。

shuffle以外のiPodの場合は、設定を手動で管理にする事でiTunesに
無い曲もiPodに存在できますが、shuffleには手動で管理にする
設定項目自体がありませんのでiTunesに無い曲はshuffleからも消えます。
つまり、どうにかなりません。

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ipod と iTunes のライブラリが同期をとっているのでしょう。

同期をとらなくすれば大丈夫です。

どっかに設定するところがあります。

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