なぜ決まった塩基同士で水素結合を取るのだろうか

普通、アデニンとチミン、グアニンとシトシンが結合するけれども、ミスマッチ結合としてアデニンとグアニン、グアニンとチミン、アデニンとシトシン、シトシンとチミンが結合する場合もあるかもしれないです。
そこで、アデニンとチミン、グアニンとシトシンの結合と上記で述べたミスマッチ結合のエネルギー的な差異を具体的に教えてください。パーセンテージで示してもいいし、具体的な数字でもいいのでよろしくお願いします。大学のレポートで調べてこいと言われて、期限は、２０１２年１２月１７日の月曜日です。他のサイトを見たのですが、なかなか見つからなくて困っています。

No.2 ベストアンサー 回答者： w6o6n 回答日時： 2012/12/12 17:56

１塩基間でのデータではありませんが、より精度が高いとされている「隣接した２塩基間」＝Nearest-Neighbor法でのデータの一例をご紹介します。

http://openwetware.org/wiki/DNAmazingProcess
（中央付近の"Nearest-neighbor ΔGo increments (kcal/mol) for internal single mismatches next to Watson-Crick pairs in 1 M NaCl"をご参照下さい）

表の見方ですが、例えばGX/CYの場合、GA/CT, GT/CA, GC/CG, GG/CCがパーフェクトマッチ、それ以外の組み合わせがミスマッチのΔGoになります。
この値を見れば、パーフェクトマッチのΔGoが低いこと、ミスマッチであっても比較的ΔGoが高いものがあることが分かるかと思います。

この回答へのお礼

とても役に立ちました。
ありがとうございました。

お礼日時：2012/12/14 18:55

No.3 回答者： tanuki4u 回答日時： 2012/12/12 18:27

http://ja.wikipedia.org/wiki/DNA%E8%A4%87%E8%A3%BD

突然変異の合成ミスのあたりの話か？

http://t2r2.star.titech.ac.jp/cgi-bin/publicatio …

http://ir.library.tohoku.ac.jp/re/handle/10097/3 …

No.1 回答者： Saturn5 回答日時： 2012/12/12 17:31

どれだけ調べましたか？

ＡＴＧＣの４種の塩基は水素結合の主体である、－ＮＨ２や－ＯＨのＨ原子と
受け手であるＮ原子、Ｏ原子の位置が対応しているのです。

エネルギー的な差違とはどのようなことを答えればいいのでしょうか？
水素結合が２カ所または３カ所あるので、その分のエネルギーが低減しているはずです。
ただし、どのような組合せの塩基どうしでも１カ所は水素結合できますので、
実際の差違は１～２個分でしょう。