中古住宅購入で、家屋又は土地等の取得対価の額が購入額より低いのですが

4年ほど前に、中古住宅を住宅及び土地等を合わせて3,300万円で購入しました。
特に深く考えずに、年末調整を毎年行っていたのですが、
今年ふと気が付いたことがありました。
「年末調整のための（特定増改築等）住宅借入金等特別控除証明書」の「家屋又は土地等の取得対価の額」の合計金額が2,100万なのです。
これは時価総額が2,100万円の住宅及び土地を、3,300万円も払って買ってしまった
ということなのでしょうか？
お詳しい方、ご回答よろしくお願いします。

No.1 回答者： hanhangege 回答日時： 2016/12/06 07:08

たとえば、購入時に親などから資金提供を受けたとか

資金の割りあいに応じて、名義を奥様などとわけているということはないですか？

ちなみに、路線価なんかは売価より低くて当たり前ですが。