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PCR法について

解決済

質問者：sakuraim
質問日時：2016/05/29 22:06
回答数：1件

初質問です。
今度、ホルマリン漬けされた糞便をPCR法で検査することになりました。
しかし、ホルマリン漬けされたものを検査することが可能かどうか調べてもわかりません。
どなたかご存知でしたら、
可能かどうか、また、ホルマリンを除去する方法があるのかを教えてください！
よろしくお願いいたします。

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回答 (1件)

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No.1ベストアンサー

回答者： hanasaka
回答日時：2016/06/01 11:27

一部引用

＞ホルマリン固定を行なうと生体分子(蛋白質や核酸)の修飾や架橋が起こるため、FFPE組織からDNAやRNAを抽出・精製するのは一般的に困難である。
＞またFFPE組織内のDNA・RNAは短い断片に分解していることが多い。
＞ホルマリン固定後パラフィン包埋標本から分離される核酸およびタンパク質の品質は、サンプルの固定あるいは包埋の操作前後、あるいは操作中にどのようにサンプルを取り扱ったかにより異なる。

最近は良いキットもできてきています。
なのでできるかもしれません。
ホルマリン自体の除去はアルコールでできるようですが、除去しても架橋や断片化は直らないのはもちろん分かっていると思います。
文献やキットメーカーを上げておきましたので直接話しを聞いてみてはいかがでしょうか？

http://snf.fra.affrc.go.jp/seika/snf00/snf00004. …
http://blog.livedoor.jp/garjyusaiga/archives/524 …
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT …
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT …
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_in …