シークエンスの波形をよくするには

DNAの配列決定（シークエンス）でやっているのですが，結果（波形）がどうも芳しくありません．
ピーク強度，ピークの伸びが悪いです．

キットはアプライドbiosystemのものです．
試薬はBigDye® Terminator v3.1，3100/3100-Avant™ Genetic Analyzer Autosamplerです．

No.1 ベストアンサー 回答者： Chicago243 回答日時： 2006/05/22 08:23

いろいろな要素があるので一概にこれがいいとはいえません。

DNAのピューリティーとクオリティー(ニックが入っていないかとか)を確認および改善してください。
DNAの量は多いほどいいですABIのプロトコールに書いている量の3倍ぐらいおおくてもいいと思います。
BIGDYEは稀釈して使ってますか?１段階濃くしてみてもいいかもしれません。プライマーもかえることで改善する可能性があります。シーケンスが特殊な構造を取りやすい場合は読めるところまで読んで、あきらめて裏を読むとか工夫が必要です。