ゲノムＤＮＡ考察について

Total RNAを合成したcDNAをテンプレートとし得られたPCR増幅産物を電気泳動にて確認したところ目的サイズ（450ｂｐ付近）にバンドが得られたのですが、目的のすぐ上（500ｂｐ付近）にもバンドが出てしまいました。
考察としてＤｎａｓｅ処理不足によるゲノムＤＮＡが表れてしまったと書いたのですが、増幅産物のサイズを根拠に考察を書くように言われました。
ちなみに時間がなく再度Ｄｎａｓｅ処理、シークエンス解析はできません。
どのように書いたらいいでしょうか・・・

No.2 回答者： Drgorilla 回答日時： 2013/01/31 16:48

（少なくとも増やしたいcDNA近辺の）ゲノムがわかっているのであればプライマー配列から増幅産物（ゲノムDNA）のサイズを推定できま

すよね？

No.1 回答者： hiddenleaf 回答日時： 2013/01/31 08:25

どんな遺伝子でどんなPCRなのかわからないのでなんとも言えませんが・・。

Alternative SplicingによるSplice Variantの可能性はありませんか？
根拠を明確にと言われると、それが一番ありえそうな気がします。

この回答への補足

説明不足で済みません。
とある理由で500bpがゲノムDNAとわかっているのですが、諸事情で現れた増幅産物の位置だけを根拠に書かなければならないんです。

補足日時：2013/01/31 14:52