シェルスクリプトでのセグメンテーション違反

Question

〇シェルスクリプト
#!/bin/sh

mkdir 2.5
files=(`ls *.dat -1`)

＃必要なファイルの振り分け
for file in ${files[@]}
do
important=`od -tu2 $file | awk 'NR==1' | awk '{print $3}'`
  if [ "$important" = 455 ] ; then
    cp $file 2.5
  fi
done

＃実行するファイルのディレクトリにて画像処理
cd 2.5
cp（cpで実行プログラムをコピー）
files=(`ls *.dat -1`)
for file in ${files[@]}
do
cp $file input.dat（実行するプログラムに対応するファイルに変更）
./cloudy_mitudo（画像処理のプログラム）

convert output.txt now.png
done

上記のプログラムを走らせたところ
./（シェルスクリプト名）.sh: line 20: 19956 セグメンテーション違反です               ./cloudy_mitudo
というエラーがでました。

普通に./cloudy_mitudoと実行した場合にはエラーが出ずにちゃんと画像処理が行えますが、シェルスクリプトにして実行した場合にセグメンテーション違反になってしまいます。
原因、対応策案をご教授いただきたいです。よろしくお願いします。

kmee · Accepted Answer

いまひとつわからないのですが。

(1)元々 /foo/ ディレクトリに cloudy_mitudo がある
(2) cd /foo/ 後に ./cloudy_mitudo は正常に動作する
(3)「/bar/hoge.dat を /bar/2.5/ に コピー 
　cd /bar/2.5/ で移動
　/bar/2.5/ に /foo/cloudy_mitudo もコピー
　hoge.dat をinput.dat にコピー
　 ./cloudy_mitudo を実行 」というシェルスクリプトで、./cloudy_mitudoがSegmentation Fault 
↑以上が、質問にある状況
(4) /bar/hoge.dat  を /foo/input.dat コピーして (cd /foo/ 後に) ./cloudy_mitudo は正常に動作
↑ 補足にある「ためしに実際にエラーが出ていたファイルをinput.datにcpしてプログラムを実行した」の具体的な内容

現状はこれで合ってますか?
もしそうなら、 元のディレクトリに依存する何かがあるのでしょう。
それ以上は、cloudy_mitudoのソースを見ないとわかりません。

また、現状がこれと異なるのなら、具体的に詳しく書いてください。
例えば 上記の (4) ではなく

(4') (3)の後に残ってる /bar/2.5/ ディレクトリで、 hoge.dat  を nput.dat コピーしての ./cloudy_mitudo は正常に動作 ← 補足にある「ためしに実際にエラーが出ていたファイルをinput.datにcpしてプログラムを実行した」の具体的な内容

だとしたら、調べるべきものが違ってきます。

前回
> cloudy_mitudo のエラー処理を強化して、どこで発生しているか調べ、それが何故起こるか仮説を立て、仮説が正しいかを調べ、何故そうなるかを考え... と、真因に辿りつくまで地道にいくしかありません。
と書いた通りです。

サンプルプログラムでは、「エラーは起こらない」ことを前提に、エラー処理を省略しているものが多いです。
使ってる関数のマニュアルをよく読んで、エラーがあったら止めるように cloudy_mitudo を作り変えましょう。

また、処理の途中に途中経過を出力するようにして、どこでエラーになったいるか、その直前でどんなことが起こっているか確認するもの手です。
(俗にprintfデバッグと呼ばれるやつです)

Tacosan · Answer

あ, 変換間違えた.

×手で売って
〇手で打って

もちろん本当に手で打たなくても, コピペでいけるならそれでもいいです.

Tacosan · Answer

ごめん, その補足の意味が分かんない.

ためしに実際にエラーが出ていたファイルをinput.datにcpしてプログラムを実行したのですが、問題なく実行されました。
現に、すべてのファイルでセグメンテーション違反のエラーが出ています＞＜

って何を言ってるんですか? 「すべてのファイルでセグメンテーション違反のエラーが出ています」っていう状態を「問題なく実行されました」と呼ぶことは非常に珍しいと思いますよ.

ちなみにちょっと確認.
「シェルスクリプトにして実行した場合にセグメンテーション違反になってしまいます」ということは, ここにあるコマンド群を全部手で売っていった場合には「セグメンテーション違反」にはならない, ということですか?

kmee · Answer

何かが違うとしか言いようがありません。

例えば、
 fp=fopen("input.dat","r") などとしてあって、 それが成功しているかどうかを確かめずに、fp=NULLのままfreadしている
とか
特定のファイルを読んだときだけエラーになる。「普通に./cloudy_mitudoと実行した場合」はエラーにならないinput.datを読んでいる
とか。

cloudy_mitudo のエラー処理を強化して、どこで発生しているか調べ、それが何故起こるか仮説を立て、仮説が正しいかを調べ、何故そうなるかを考え... と、真因に辿りつくまで地道にいくしかありません。

例えば
cp $file input.dat（実行するプログラムに対応するファイルに変更）
を
cp -v $file input.dat
にすれば、どのファイルを処理したかがわかります。
いつエラーになるかもわかるはずです。

エラーとは別件で。
・convert output.txt now.png
　だと、複数.datファイルがあっても、最後の結果しかnow.pngとして残りませんが、それでいいのですか?

・入出力ファイルをプログラム中で固定するのではなく、 標準入出力を使って cloudy_mitudo < 入力 > 出力みたいにするとか、コマンドライン引数を使って cloudy_mitudo 入力 出力 みたいにすると、こんな複雑なスクリプトにしないで済みます。

シェルスクリプトでのセグメンテーション違反

いまひとつわからないのですが。

あ, 変換間違えた.

ごめん, その補足の意味が分かんない.

何かが違うとしか言いようがありません。

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