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分子生物学にお詳しい方、教えてください。
シトシンが低い頻度において、シトシンがウラシルに、5-メチルシトシンがチミンに変化するには、アミノ基がとれて、酸素が結合する必要があるかと思いますが、これは、脱アミノ化が起きて、酸化反応が生じるような、いわば、多段階反応が起きる必要があるのでしょうか?
アミノ基がとれるだけで、酸化されないようなことは生じるのでしょうか?
もし、そのようなことがあれば、塩基ではなくなり、すぐに修復の対象となるものなのでしょうか?
この変異は、生体内でどのようなことが原因で生じるのでしょうか?
大変、恐縮でございますが、お詳しい方、是非とも、よろしくお願い致します。
No.2ベストアンサー
- 回答日時:
決して 詳しくは無いのですが、お邪魔致します。
m(_ _)m 質問者さまのご質問では、かえって こちらが勉強させて頂いております。ありがとうございます。m(_ _)m● > シトシンが低い頻度において、シトシンがウラシルに、5-メチルシトシンがチミンに変化するには、アミノ基がとれて、酸素が結合する必要があるかと思いますが、これは、脱アミノ化が起きて、酸化反応が生じるような、いわば、多段階反応が起きる必要があるのでしょうか?
シトシン → ウラシル、5-メチルシトシン → チミン の反応は、脱アミノ化反応 (脱アミノ反応) ですね。この脱アミノ化反応は、加水分解による アミノ基の水酸基への置換 です (下記引用)。ですので、「多段階反応」 では無い ように思います。
201329 DNAの塩基にUが使われない理由? (生物史から、自然の摂理を読み解く)
http://www.biological-j.net/bbs/bbs.php?i=200&c= …
DNAの変化 (DNA修復)
↑ 「脱アミノ反応」 の項目をご覧下さい。
http://133.100.212.50/~bc1/Biochem/repair.htm
● > アミノ基がとれるだけで、酸化されないようなことは生じるのでしょうか?
> もし、そのようなことがあれば、塩基ではなくなり、すぐに修復の対象となるものなのでしょうか?
上記のように、脱アミノ化反応が多段階反応で無い のであれば、「アミノ基がとれるだけで、酸化されないようなこと」 は生じない と考えます。
● > この変異は、生体内でどのようなことが原因で生じるのでしょうか?
DNAの変異についての一般的な原因であれば、紫外線や化学物質 (発癌物質 など) などが挙げられると思いますが、上記の脱アミノ化反応の原因となると、残念ながら 不勉強で、特定できません。m(_ _)m ただ、生体内で起こっているかは 定かではありませんが、亜硝酸は 「強い脱アミノ化剤である」 (上記引用2) そうです。
また、上記引用1 では、「そもそもC(シトシン)には、変異が起こりやすい部分があることが知られています。 >Cは4位にアミノ基がついてますが,アミノ基(-NH2)は酵素反応でなく,細胞内で自然に加水分解され酸素に置き換わりUになります >32億塩基対のヒトDNAには14億ほどのCがありますが,1日に約120分子がUに変わるそうです.微々たるものですが,とにかくDNAが自然に変化することは確かです」 (原文ママ) とあり、「自然に」 の意味するところが難しいのですが、さしたる特別な原因もなく、この脱アミノ化反応は 起こるのではないか と、私は解釈しました。
…最後に、質問者さまの先日のご質問では、私の回答No.2 の不心得で、質問者さまから頂戴した 【お礼】 まで、"巻き添えを食う" こととなってしまい、大変なご迷惑をお掛け致しました。お詫び申し上げます。 ただ、この 【お礼】 自体は、幸い、拝見することができました。過分なお言葉、痛み入ります。m(_ _)m とても励みになります。^ ^
今回引用のサイトは、全てよそさまのサイトです。ありがとうございます。m(_ _)m
毎度、ご回答いただきまして誠にありがとうございます。
シトシン → ウラシル、5-メチルシトシン → チミン の反応は脱アミノ化反応という反応で、加水分解による、アミノ基の水酸基への置換なんですね。しかも、酵素反応ではなく、自然に置換しやすいのですね。
シトシンは、変異が入りやすい部位があり、32億塩基対のうちの14億ほどのシトシンが一日、120分子がウラシルに変わってるんですね。非常に、具体的で、衝撃的でありました。
本当に、毎回、しかも、感銘を受けるご回答どうもありがとうございます。
ただ私の質問に答えてくださるだけでなく、ご自身の見解もそえてくださることで、非常にわかりやすさが増強されておりますし、何よりも嬉しく思っております。
pseudos様のご回答は、私の知識の隙間を埋めていただいており、私の宝であります。
毎回、回答いただいているのを、見るたびにテンションがあがってますし、スッキリしてます。本当に、感謝しております。
大変、厚かましいですが、またご回答いただけると、嬉しいです。
今回もどうもありがとうございました。
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