No.1ベストアンサー
- 回答日時:
ゲノム配列から予測するにはコンピュータの助けを借りるのが普通です。
予測なので、本当に転写・翻訳されるかどうかは実験的な裏付けが必要ですが、かなり当たっているのでははないでしょうか(少なくともORF・翻訳されるexonの抽出に関しては。転写開始点やexon-intron構成の予測は難しいところがある)。詳しくは知りませんが、有意な長さで連続する予測ORFを抽出して、コドンなどでスコア化し、予想翻訳配列がタンパク質としてあり得そうか予測するとかなんとかする思います。
このようなソフトウェアは、そこそこの性能のものは市販の遺伝子解析ソフトウェアについていますし、web上のサービスとしてもあります。
たとえば、
http://linux1.softberry.com/berry.phtml
ほかにもあると思います。「gene finder」「ORF search」などで検索してみるといいでしょう。
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