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No.1ベストアンサー
- 回答日時:
DNAはタンパク質ほど残基の違いによって性質が変わるわけではありませんが、
それでも配列によって違う構造をとったりします。
増やしたいの配列がGC-richだったり、
インバーテッドリピートなどの高次構造をとりやすいものだと
伸長反応が止まってしまい、
増えにくくなる場合があります。
バッファーやDNAポリメラーゼを替えたり、
7-deaza dGTPを使うことによって
改善する場合があります。
この回答への補足
回答ありがとうございます
なるほど、そういう理由がかんがえられるのですね
大変参考になりました
>増やしたいの配列がGC-richだったり、
インバーテッドリピートなどの高次構造をとりやすいものだと・・・
NESTEDプライマーではきちんとPCRプロダクトが産生されているので大丈夫だと思うんですが。。。
プライマーはすべて20塩基で、GC含量が、11~12個(50~60%)になるように設計してます
>バッファーやDNAポリメラーゼを替えたり、
7-deaza dGTPを使うことによって
改善する
私の研究室には残念ながら備えがありません
また新しくプライマーを設計しなおしたほうがよさそうですね
なかなか難しいです
ありがとうございました
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