相関の検討について

相関について検討をしたいのですが、どのように分析するのが適切でしょうか？

今、ある実験を通して得られた変数Aと変数Bの相関を調べたいと思っています。
これらの変数に関しては、被験者１人について同じ実験を２回ずつ実施しているため
被験者１人についてA1,B1,A2,B2という４つの変数が得られている状態です。
この場合に、どのような分析をするのが適切でしょうか？
単純にA1とA2、B1とB2を同じように扱う（同一の被験者の結果として扱わない）よりは
同一の被験者による結果であることを用いた方がいいようには思うのですが…
たとえば、A1-A2とB1-B2の相関を見る、といったやり方は不適切でしょうか？

No.1 回答者： kgu-2 回答日時： 2008/09/30 19:21

なぜ２回測定されたのでしょうか。

普通は、１回です。もし。データにばらつきが大きいなら、平均値が一般的ですが、２回ではなく、私なら３回やりますが。

>、A1-A2とB1-B2の相関を見る、
意味<不明。

　私なら、２回目はしません。面倒になるので。
するとしても、１回目の結果、２回目の結果とそれぞれまとめます。結論が異なれば厄介ですが、それなりの理屈をひねり出せば済むことです。同じなら、２回目のものを外部に出す必要はありません。