No.1ベストアンサー
- 回答日時:
ご存知かもしれませんが、フェノールはタンパク質を変性させる疎水性物質で、
細胞膜も破壊します。
私はTRIzolを使っていましたが、柔らかい組織ならvortexでかなり懸濁できます。
フェノールは疎水性とはいえ、OH基があるため若干の水溶性があります。
なので、フェノールと水を混ぜて遠心すると二層に分かれますが、水層にも多少溶けています。フェノールは変性作用があるため、後々のPCR等の酵素反応を阻害してしまいます。
フェノールを使ってタンパク質を変性させ、タンパク質の疎水基を露出させることによって中間層に集めるわけですが、後のことを考えてできるだけフェノールは水層から取り除きたいわけです。
クロロホルムにはフェノールのような変性作用はありませんが強力な疎水性物質なので、フェノール+水の溶液に加えるとフェノールを疎水層にほぼ完璧に溶解させることができます。
なのでRNA抽出でもDNA抽出でもクロロホルムの作用はその強力な疎水性でタンパク質を
中間層に集める作用(これはフェノールでも可)とフェノール自体を水層からできるだけ
除去するという作用があるのだと思います。
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