Km値の求め方がわからなくてとても困っています。
乳酸脱水素酵素活性の測定という実験をしました。
リン酸緩衝液、ピルビン酸ナトリウム、NADH、ネズミの肝臓のホモジネートが入った溶液の吸光度を15秒間ごとに測り、吸光度の減少率(ΔA/min)を求めた。
減少率は0.416でした。
酵素活性(反応速度)は0.02×10^6となりました。
ホモジネートのたんぱく質濃度は1.34
酵素の比活性は14.97でした。
この結果からKm値を求めないといけないんですが、まったく計算の仕方がわかりません。
ラインウェーバーバークのプロットが検索でひっかかるのですが、どの値を使えば求められるかわかりません、
ラインウェーバーバークのプロットで求めることができるのかもわかりません。
どなたか分かる方、教えてください。
お願いします。
A 回答 (3件)
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No.3
- 回答日時:
誰がなんといおうと,その実験結果から Km 値は求められませんし,こうやれば求められるとかいう方法は,基本的に間違いです.
もちろん,他の実験からわかっていることを併用していいなら話は別ですが,Vmax がわかっているとかでないとだめですね.
Michaelis-Menten 式には,速度と基質濃度を関係づけるためのパラメータが二つあるのです.その二つのパラメータを,ひとつの実験条件だけから決定することは,数学の論理としてありえません.
もっとも,それとは別に LDH に Michaelis-Menten 式を使えるのかという根本問題もありますが.一点だけのデータでは,適合性もわからないので,みかけの値にしても Km という値を求めることの根拠もないわけで,そういう意味でも課題設定が無意味かつ不毛です.
No.2
- 回答日時:
基質濃度一点しか測ってないなら,Km値を計算する方法はありません.
「Km値を求めないといけない」なら,求められるような実験をしなくてはいけませんが,そういう実験をしていないのですから,求めようがありません.
適切な濃度範囲で基質濃度を4~5点以上くらい変えて速度を測っているなら,Lineweaver-Burk プロットなり,Eadie-Hofstee プロットなりで Km 値は求められます.NADH 過剰という条件で,ピルビン酸濃度を変えれば,ピルビン酸に対する Km が求められますが,NADH 過剰という条件を満たしているかどうか担保されていないなら,そこも検討する必要があります.
ここまで書いたついでにいうと,解析方法もわからずに実験作業をするのは無意味です.順番が逆です.
この回答への補足
Km値を求める実験ではないと思っていたのですが、
実習レポートの課題としてKm値を求めなさいと言われてしまい、
自分の中で???となってしまったんです。
先輩に聞いたところ、最適条件からKm値が求められると言われたんですが、
よく分からないので困っています。
0.1mMリン酸緩衝液2.63ml
100mMピルビン酸ナトリウム0.3ml
10mM NADH0.06ml
ホモジネート0.01ml
ホモジネートを入れる前の吸光度は1.045
NADHの濃度は0.17mMと分かる
ホモジネートを入れてから15秒ずつ、3分間吸光度を測り続けた
この結果から吸光度は減少率は0.416
酵素活性は0.02×10^6
ビュウレット法によりホモジネートのたんぱく質濃度を求めた、
たんぱく質濃度は.35mg/ml
酵素の比活性は14.97
と求められました。
これらの結果からKm値を求めることはやっぱり不可能なことですか?
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