分散分析の誤差について

現在，心理学の統計で分散分析を行っています。
1要因に対応が無く，1要因に対応がある2要因の混合分散分析を行っています。(データ数が異なる)
現在使用しているソフトのバージョンでは混合分散分析ができないため手計算を行っています。

そこで問題が発生したのですが，参考書(心理学のためのデータ解析テクニカルブック)を見てやっているのですが，
平方和(SS)の誤差がどうしてもマイナスの値になってしまいます。
主効果の誤差は大丈夫なのですが，交互作用の誤差ででます。
良いのでしょうか?
以前，習った時にマイナスは出ないので出た場合には計算間違いだよ!と言われた気がして前に進めません。

すみませんが，よろしくお願いします。

No.1 ベストアンサー 回答者： selfer 回答日時： 2005/01/21 19:37

こんにちは．

私も参考書に基づいた分散分析のテンプレートを使っており，同じような状況に陥ったことがあります．その原因としては，「同じ被験者のデータに欠損値があること」が挙げられます．少なくとも，参考書に基づく計算方法であれば，そのようになっています．

分散分析は「データ数が等しい」が基本ですが，多少，「データ数が異なる」場合でも計算できるように工夫されています．しかし，そのような場合であっても，同じ被験者，すなわち「対応あり」要因についてはデータは揃っていなければならない，という条件が満たされなければなりません．

おそらく，質問者様のデータには，人によって全回答をしていないものがあるのではないでしょうか？　そのような場合ではSSはマイナスになることがあります．

対処法としては，その欠損値を何らかの形で代用値を使って埋めるか，あるいは，全回答をしていない人についてのデータをばっさり捨てることが挙げられます．ただし，前者の代用値については，どのようにして代用値を求めるかという問題があるので，後者が簡単な対処法だと思います．

計算ミスというよりは，計算対象のデータとして不適切な箇所がある，ということですね．