セリンやチロシンがリン酸化されることで翻訳後修飾としてタンパク質の活性が制御されるということについての質問なのですが。
あるタンパク質があるとして、そのアミノ酸配列にはセリンが何個か含まれているとします。そのセリンは全てリン酸化される潜在性があるのでしょうか?
何個かあるセリンのうち特定のものだけがリン酸化されるということは起こりうるのでしょうか?
だとしたらリン酸化される部分とされない部分の区別は周辺の配列とかから判別できたりするのでしょうか?リン酸化サイトを予想することはできるのでしょうか?
以上よろしくお願い致します。
No.1ベストアンサー
- 回答日時:
>そのセリンは全てリン酸化される潜在性があるのでしょうか?
ないとは言えません。
>特定のものだけがリン酸化されるということは起こりうるのでしょうか?
それが普通です。
何番目のセリンがリン酸化されるとどうなるかを特定する必要があります。
>周辺の配列とかから判別できたりするのでしょうか?
既知の類似タンパクやドメインなどからある程度当たりは付けられます。
>リン酸化サイトを予想することはできるのでしょうか?
予想してもそれを証明しないとサイエンスになりませんから、
結局はセリン残基を置換してin vivoまたはin vitroにおける挙動を調べたり、
さまざまな条件下の細胞から取得して調べたりする必要があります。
No.2
- 回答日時:
予測に関して、例えば下記のURL先のツールがあります。
おおよその見当をつけて実験を始めることが多いと思います。参考URL:http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/
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