制限酵素と回文配列

制限酵素についての質問です。
制限酵素がDNA二本鎖の回文配列部分を切断する際、どのようにして回文配列を認識するのですか？？制限酵素に何か特殊な構造が備わっているのですか？？

回答をよろしくお願いします。

No.3 ベストアンサー 回答者： Dr_Hyper 回答日時： 2006/12/18 00:30

２つの分子が一つの配列GAATTCなどを認識するのですが、

まったく同じものが、同じもの同士を同じタンパク表面で認識するには、DNA上で向き合う必要がありますよね、そのためDNAの配列の方も向き合った形になっているのです。ちなみにご存知の通り、DNAは二本鎖ですので、GAATTCの裏側の入れつもGAATTCになっているのはいいでしょうか。

No.2 回答者： geneticist12 回答日時： 2006/12/17 22:30

いっぱい論文があるのでいろいろ漁ってみてほしいのですが、、

よさそうなreviewがあったので参考URLに挙げました。

簡単に言うと、ほとんどの制限酵素はhomodimerか、認識配列上で2つのmonomerが会合して作用します。monomerのそれぞれが同じ配列を認識するので、２つ合わさると回文構造になる、という理解でよいかと思います。

参考URL：http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/abstra …

No.1 回答者： geneticist12 回答日時： 2006/12/17 19:04

結晶構造解析の分野では、制限酵素の構造解析をしてどのように認識配列にくっつくかを調べた論文が数多く出ています。

いちどそのような論文を読んでみてください。

Google shcolar http://scholar.google.com/
で「restriction enzyme crystal structure」とでも入れて検索すれば見つけられるでしょう。参考URLはそのなかの一つで、BglIの論文のpdfダウンロードです。

参考URL：http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi? …

この回答へのお礼

いまいちよく理解できません。。
つまり対称形であるということですか？？

お礼日時：2006/12/17 20:20