アガロースゲルの泳動について

アガロースゲルで電気泳動すると短いバンドが歪みます。何故短いバンドだけ歪むのでしょうか？bufferは0.5×TBEを使用しています。
理由がわかれば教えてください。

No.2 回答者： 平和の使者-安倍晋三 回答日時： 2021/02/27 03:45

時間があれば横からゲルを観察すると分かるとおもいます。

その際は目に直接UVが当たらないように気を付けてください

No.1 回答者： 平和の使者-安倍晋三 回答日時： 2021/02/27 01:57

分子量の違いによってゲルの中を移動する速度が変わるので、バンドとして分離することができます。

そのため、短いバンドが長いバンドよりも速くゲル中を進みます。
また、アガロースゲル中に流れる電気は一定ではないため、ゲルの中で若干の勾配ができます。
このことから、短いバンドほどゲル中を進み、ゲル中の電気勾配の影響を受けるのでバンドが歪みます。

あとは微々たる影響だと思いますが、電気を15分程度ながし続けるので熱によってゲルが歪むことも考えられます。
粗悪な機器を使ってた昔の人は冷蔵庫で冷やしながら泳動したらしいですよ。