DNAシーケンス ジデオキシ法

ジデオキシ法に用いるプライマーはどのように決定するのですか？
塩基配列を知りたいからシーケンスを行うのだから、鋳型DNAに特異的なプライマーを設計するのは無理な気がするのですが…
レベルの低い質問で恐縮ですが教えてください

No.1 ベストアンサー 回答者： MIYD 回答日時： 2008/11/23 21:01

１．クローニングベクターに入れて、ベクターにアニールするプライマーを用いる

２．適当な配列をライゲーションして、そこにアニールするプライマーを用いる

一度、クローニングについて調べてみましょう。

この回答への補足

回答ありがとうございます。
よく分かりました。
クローニングについてもっと勉強してみます。

補足日時：2008/11/24 12:05

No.3 回答者： oil-sour 回答日時： 2008/11/24 08:07

googleで一発目に出てくる記事ですが、わかりやすいです。

http://www.jpo.go.jp/shiryou/s_sonota/hyoujun_gi …

ジデオキシ法（サンガー法）についてはここを見ればよくわかるかとおもいます。
ちないに、まったく未知の領域をライブラリの中から見つけ出した後シークエンスを決定したい、という場合はライブラリベクター側の配列を使う訳です(いわゆるM13 primerなど）。

この回答への補足

回答ありがとうございます
M13よく本で見かけます。もっと自分で勉強するべきですね
頑張ります

補足日時：2008/11/24 12:11

No.2 回答者： tunertune 回答日時： 2008/11/23 21:06

ターゲットがある程度分かっているのならば、そのターゲットに保存されている領域にプライマーを設計すればいいのでは？

そもそもシークエンス用にPCRを使うのであれば、PCRに使ったプライマーでシークエンスすればいいのでは？

この回答への補足

回答ありがとうございます。
よく分かりました。

補足日時：2008/11/24 12:13