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大雑把に言いますと、アミロイド変性とフィブリノイド変性はおっしゃる通り、ある組織に過剰にアミロイドやフィブリノイドが沈着する事です。
これらの物質があまりに多く沈着すると、細胞が死んだり活性が落ちたりして組織の本来の機能が果たせなくなる訳です。(機能が落ちるので沈着するのかもしれませんが、そこら辺は非常に専門性が高い話となります。)対して、線維化はその組織の中で線維芽細胞が膠原線維をいっぱい作ってしまうことをいいます。多くの場合それは、組織が損傷を受けたとき補修する為に生じます。ただ、損傷が大きかったり、長い期間にわたると、その組織は膠原線維だらけとなり、本来の機能が失われてしまう訳です。
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