タンパクの構造解析について

helical wheel analysisについて教えて下さい。
お願いします。

No.3 回答者： MiJun 回答日時： 2002/03/05 07:33

ダイレクトな回答ではありませんが、以下の成書が参考になるかもしれません？

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タンパク質フォールディングのキネティクス／Ｂｅｎｇｔ　Ｎｏｌｔ…［他］／シュプリンガー・フェ…／２０００．６　
タンパク質のＸ線結晶解析法／Ｊ．ドレント［他］／シュプリンガー・フェ…／１９９８．１　
タンパク質工学の物理・化学的基礎／江口至洋／共立出版／１９９１．６
タンパク質の構造入門／Ｃａｒｌ　Ｂｒａｎｄ…［他］／ニュートンプレス／２０００．４
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これらで下の２冊がお薦めです。

さらに少し外れますが、ＰＮＥ（蛋白質核酸酵素）で昨年から「バイオインフォマティクス」という連載があります。

ご参考まで。

No.2 回答者： o0o 回答日時： 2001/06/08 13:50

ある α-helix を車輪モデルで書いたときに

片側に疎水性アミノ酸、もう片方に親水性アミノ酸が集まることがあります。

この場合、疎水性領域は蛋白質内部に埋め込まれ、
親水性領域は外側を向き水にさらされているだろうという推測がつきます。

また、複数の helix が膜を貫通して、穴を作るようなばあい、
疎水性部分は膜と接触し、親水性領域は溶媒が通る方の側に位置する
と推測されます。

No.1 回答者： o0o 回答日時： 2001/06/08 08:21

α-helix は 3.6 アミノ酸残基で１回転しますので、

１残基ごとに１００度回転します。

このため、丸い輪を書いて、１００度ごとにアミノ酸を置けば
車輪モデルになります。

元論文は Biophys. J., 7: 121-135(1967)

この回答へのお礼

ありがとうございました。
この車輪のモデルで何が分かりますか?
できれば教えてほしいです。

お礼日時：2001/06/08 12:11