HIV検査では陰性なのに軽度異形成の診断

年に一度行っている子宮頸がん検診で初めて要精密検査の通知が来てしまい、精密検査をしたところ結果は軽度異形成でした。今後経過観察していく上でウイルスの型を知りたいと言われ2ヶ月後くらいにHPV検査を受けました。しかし結果は陰性。先生も「陰性...？陰性か...。」みたいな反応でした。そして「少し時期を空けて再検査した方がいい」と言われ、1年後再検査になりました。
軽度異形成の経過観察として3ヶ月に1度頸がん検診を受けるということになっていますが、先生の反応が気になるのと再検査が思っていたより先だったことに不安があります。単に上手く検体が取れていなかったということでしょうか...？