残基について質問です。以下のような問題が
ある大学入試の問題集に載っていたのですが、
残基についてよくわからないことがありましたので質問いたしました。
「ある細菌のDNA分子量は2,6×10^9、1対のヌクレオチドの平均分子量は6,6×10^2
時のDNAのヌクレオチド数は何個か?」
という問題がありました。
私は「1対のヌクレオチドの平均分子量は6,6×10^2」とあって、「残基」とかかれていないので
-18をするのかと思い。2,6×10^9ー18÷6,6×10^2×2かとおもったら、
解答では2,6×10^9÷6,6×10^2×2と-18をしていませんでした。
これはなぜでしょう?
また、「たんぱく質の平均分子量は4,8×10^4たんぱく質を構成するアミノ酸の平均分子量は
138であるときのアミノ酸の数は何個か?」
という問題があったときも、アミノ酸の平均分子量に残基と書いていないので-18をして計算するのかとおもったらそのまま
4,8×10^4÷138としていました。
残基とかかれていなくても-18しなくてもいい理由を教えてください。
No.5
- 回答日時:
核酸にしろタンパク質にしろポリマーの分子量とモノマーの分子量でヌクレオチド数やアミノ酸数を算出するなら、ヌクレオチド残基やアミノ酸残基の分子量を使わなければなりません。
「1対のヌクレオチドの平均分子量」からは 36 を、「アミノ酸の平均分子量」からは 18 を引いて残基の分子量にします。
ポリマーの末端の残基は片側しか脱水縮合していないので、ポリマーの分子量から 18 を引いて全ての残基の両側が脱水縮合したものとして計算しなければなりません。もちろん二本鎖 DNA の分子量からは 36 を引きます。
質問のヌクレオチドの問題は
(2.6 x 10^9 - 36) / (6.6 x 10^2 - 36)
有効数字が二桁なので、途中計算は三桁で行ないます。
分母のヌクレオチド残基の分子量を計算すると 6.24 x 10^2 ですから、有効数字で無視できる誤差の範囲を超えてます。
分子は三桁に直すと 2.60 x 10^9 なので、-36 は有効数字で無視できるということになります。
タンパク質の方も同様にアミノ酸残基の分子量にとって水の分子量は無視できませんが、タンパク質の分子量に対して水の分子量は無視できます。
No.3
- 回答日時:
アミノ酸が結合するごとに水分子(分子量18)が取れるのですよね。
三つのアミノ酸なら、二つ水分子が取れるのです。100個のアミノ酸がつながれば、99個の水分子が取れるのです。
アミノ酸がN個つながれば、(N-1)個の水分子が取れるのです。
以上が難しいのならば、
単純にアミノ酸一つの平均分子量(138)から水分子の一つ分を引いた、いうなればアミノ酸残基の平均分子量(138-18)だけで考えてもいいですよ。
タンパク質は、アミノ酸残基が連結していると考えれば、アミノ酸残基の分子量で、タンパク質の分子量を割ればアミノ酸の数がでるでしょう。アミノ酸の数をNとすると。
N= 4.8×10^4÷(138-18)=48000 ÷ 120 =400
何から18を引くべきなのかを考えるか、教わるかしてください。引く相手を間違えていませんか。
No.2ベストアンサー
- 回答日時:
受験生ではなく、趣味ですよね。
大学入試試験の過去問なのでしょうか。
その回答が実際の採点における正解ならば、入試問題としては?ですね。
タンパク質の分子量=
n×(「アミノ酸の平均分子量」)-18(n-1)= n×(「アミノ酸の平均分子量」-18)+ 18
の方程式でしょう。
タンパク質の分子量(48000)から、18を一つ引いて、…(1)
その残り(47982)を
120(=138-18)…(2)
で割って、
アミノ酸の数を求めるべき受験問題じゃないですかね。
(1)は有効数字に消される誤差ですから無視できますが、
(2)が138だったら答えがぜんぜん違うでしょう。
ちなみに計算ずくめの化学でこのレベルですから、生物学の計算なんて、解答の是非が、誰からも指摘されずに放置されてしまうのでしょうね。
http://oshiete.goo.ne.jp/qa/6695742.html
解答ありがとうございます。
まだちょっと混乱しているのですが、詳しいわかりやすい
説明のおかげで理解できた気がします。
ありがとうございました。
No.1
- 回答日時:
-18はもしかして、端にあるHとOHの分子量でしょうか?
平均分子量を使った概算なので18くらいは無視できると考えていいと思います。
残基と書かれているかどうかで判断するのは何か変です。
学校でそう習ったんでしょうか?
あと、一般的に残基と言ったら蛋白質を構成するアミノ酸ひとつひとつのことを指していて、核酸の場合は残基とは言わず塩基(対)と言います。
解答ありがとうございます。
>残基と書かれているかどうかで判断するのは何か変です。
>学校でそう習ったんでしょうか?
そうです。もし、残基とかかれていなかったら、-18をして計算することと
教えられたので、この問題もそうなのかなあ?と思ってしまったのですが。。。
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